湖州市中医院，为浙江省最早建立的中医院之一，是一所集医疗、教学、科研、预防保健于一体的三级甲等中医医院，系浙江中医药大学附属医院，江西中医药大学、杭州医学院、湖州师院医学院等教学医院，国家中医住院医师规范化培训基地。医院先后被授予“全国卫生文明先进集体”“浙江省文明中医院”“浙江省文明单位”“浙江省平安医院”“浙江省绿色医院”“全国中医药系统创先争优活动先进集体”等荣誉称号。

拥有“国家级”建设专科及项目3个：外科为国家中医药管理局“十一五”重点专科，推拿科为国家中医药管理局“十二五”重点专科建设项目和国家中医优势专科建设单位，治未病中心为国家中医药管理局中医药预防保健及康复与临床服务能力建设项目；有中西医结合肿瘤内科等省级重点学（专）科12个；针灸推拿科等市级重点学（专）科13个；有王永钧全国名中医工作室、黄煌经方湖州工作站、范炳华名中医工作室、范永升首届全国名中医传承工作室、全国首届岐黄学者方剑乔名中医工作室湖州站、傅瑞阳名老中医专家传承工作室、程祖耀名老中医专家传承工作室等各级名中医工作室21个。

医院是国家第三批中医住院医师规范化培训基地，浙江省首批中医住院医师规范化培训基地，近三年基地住培学员结业考核通过率均在95%以上。拥有三个社区协同基地：湖州市吴兴区朝阳爱山街道社区卫生服务中心、湖州市吴兴区仁皇山滨湖街道社区卫生服务中心、八里店镇卫生院。